5月16日,我院经作所棉花分子育种创新团队在Top期刊《理论与应用(Theoretical and Applied Genetics)》(IF=5.70,植物科学一区)上发表题为“Genome‑wide association study
reveals novel quantitative trait loci and candidate genes of lint percentage in
upland cotton based on the CottonSNP80K array”的研究论文。该论文开展了基于CottonSNP80K基因芯片的陆地棉全基因组关联研究,揭示了陆地棉中与产量重要性状衣分显著相关新的数量性状位点和候选基因,为后续深入解析棉花产量的分子机制提供理论支持。
本研究以254份陆地棉为材料,采用CottonSNP80K基因芯片进行基因分型,共获得41413个高质量的SNPs,用于遗传结构分析和GWAS。结果共发现34个与衣分性状显著相关的SNPs,对应22个QTLs。通过WGCNA和qRT‑PCR分析,确定了Gh_D01G0162和Gh_D07G0463为调控衣分性状的候选基因,并得到与衣分显著相关的SNPs标记,为深入解析棉花产量重要农艺性状衣分(LP,%)变异的遗传分子机制提供了重要见解,为通过分子标记辅助育种(MAS)改良衣分奠定了基础。
本研究得到了国家自然科学基金、山东省农业良种工程、国家棉花产业技术体系和国家重点研发计划等项目资助。经作所陈煜副研究员和高阳助理研究员为论文共同第一作者,张军、王芙蓉研究员为共同通讯作者。
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00122-022-04111-1
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